شورای عالی انقلاب فرهنگی در جلسه 454 مورخ 30 /9 /78 ماده 5 اساسنامه جهاد دانشگاهی (ابلاغیه شماره 2934 /د ش مورخ 27/8/1378) را با اصلاحاتی به این شرح تصویب کرد: ماده 5: هیئت امناء به عنوان عالی ترین مرجع سیاستگذاری جهاد متشکل از این افراد است: 1- رئیس جهاد دانشگاهی (رئیس هیئت امناء). 2- وزیر فرهنگ و آموزش عالی یا نماینده ایشان. 3- وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی یا نماینده ایشان. 4- رئیس سازمان برنامه و بودجه یا نماینده ایشان. 5- دبیر شورای عالی انقلاب فرهنگی. 6- رئیس نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری در دانشگاهها یا یکی از اعضای شورای نمایندگان مقام معظم رهبری در دانشگاهها به انتخاب آن شورا. 7- سه نفر از شخصیتهای علمی، فرهنگی و اجتماعی یا اعضای هیئت علمی جهاد دانشگاهی به پیشنهاد رئیس جهاد دانشگاهی و بر اساس ماده 2 اصلاحی قانون تشکیل هیئتهای امناء دانشگاهها. تبصره: احکام اعضای هیئت امنا از سوی رئیس شورای عالی انقلاب فرهنگی و به مدت چهار سال صادر خواهد شد.
رییسجمهور و رییس شورای عالی انقلاب فرهنگی - سید محمد خاتمی